联合专家组:建立一个整合全球所有新冠基因组的整合数据库
2021-03-31 16:53 羊城晚报•羊城派 原创
包括基因组序列、流行病、宏基因组以及环境等相关的数据

文/羊城晚报全媒体记者 王莉

3月31日,中国—世界卫生组织新冠病毒溯源联合研究中方专家组在北京举行新闻发布会,介绍新冠病毒溯源联合研究报告有关情况。

中国科学院北京基因组研究所副所长、联合专家组分子流行病与生物信息学组中方组长杨运桂介绍了本次溯源工作中分子溯源方面的情况。

他表示,分子溯源主要围绕几方面工作展开:系统梳理我国武汉早期病例的基因组序列,系统收集整理全球早期的病例系列以及对应的国家的分布,系统收集整理已知的不同物种基因组序列,构建分子溯源最关键的也是最核心的基因组序列以及信息数据库。

通过世卫联合专家组分子组的工作,建立了全球新冠病毒信息资源库,整合了基因组以及可及的流行病学、临床等数据,为顺利开展分子溯源的研究提供数据和信息。

与此同时,通过分子数据与流行病数据的整合分析,系统研究了这个系列的变异与各类暴露因素的关联关系以及规律,为溯源的方向提供了重要参考。此外,还有基于早期的病毒序列的系统演化分析,和它最早共同祖先出现的时间的理论计算,来研究早期病毒的传播演化特征与规律,对武汉早期的新冠疫情进行了系统研判。

“另外一个很重要的工作,是全面整合了全球已经公开的早期病例、环境或更早期存留样本的新冠病毒检测和测序的系列信息,尤其是系统梳理了早于武汉的疑似病例的阳性样本序列,主要在国外。”杨运桂说。

杨运桂介绍,基于分子溯源工作,联合专家组达成一致,在全球框架下提出了四点建议:

第一,要建立一个整合全球所有新冠基因组的整合数据库,由世卫组织协调,包括基因组序列、流行病、宏基因组以及环境等相关的数据。

第二,基于系统分析了中国早期的新冠病毒的原始基因组序列,提出了对全球下一段溯源工作一个非常重要的指南性的要求,在测序深度和测序平台之间提出了建议。

第三,通过文献的梳理,专家组也认同,比武汉更早的国外序列样本的存在,提出了要在全球范围内继续跟踪早期全球的病例样本。

第四,提出扩大在全球范围内物种的筛查。(更多新闻资讯,请关注羊城派 pai.ycwb.com)

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